Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNDP1Q96KN2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms