Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PRAC1Q96KF2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PRAC1Q96KF2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms