Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MS4A4AQ96JQ5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms