Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CENPNQ96H22 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CENPNQ96H22 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms