Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MALSU1Q96EH3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms