Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRIM63Q969Q1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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TRIM63Q969Q1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRIM63Q969Q1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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