Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBXN4Q92575 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBXN4Q92575 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms