Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLEC4DQ8WXI8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLEC4DQ8WXI8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms