Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC107Q8WV48 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC107Q8WV48 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms