Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DEPDC1BQ8WUY9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DEPDC1BQ8WUY9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms