Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
COL22A1Q8NFW1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
COL22A1Q8NFW1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL22A1Q8NFW1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms