Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMIEQ8NEW7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMIEQ8NEW7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms