Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHDC9Q8NEP7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLHDC9Q8NEP7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KLHDC9Q8NEP7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms