Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC197Q8NCU1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC197Q8NCU1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms