Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00612Q8N6U2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms