Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC155Q8N6L0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC155Q8N6L0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms