Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCGF5Q86SE9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCGF5Q86SE9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms