Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD4Q7Z3J3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RGPD4Q7Z3J3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RGPD4Q7Z3J3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms