Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC8DQ7L1W4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC8DQ7L1W4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms