Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX8Q6ZV50 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX8Q6ZV50 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms