Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC73Q6ZRK6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC73Q6ZRK6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms