Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TPTE2Q6XPS3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPTE2Q6XPS3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TPTE2Q6XPS3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TPTE2Q6XPS3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPTE2Q6XPS3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPTE2Q6XPS3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPTE2Q6XPS3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPTE2Q6XPS3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPTE2Q6XPS3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TPTE2Q6XPS3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPTE2Q6XPS3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TPTE2Q6XPS3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPTE2Q6XPS3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms