Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWF3

SCIMP, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCIMPQ6UWF3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SCIMPQ6UWF3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SCIMPQ6UWF3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms