Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C16orf54Q6UWD8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C16orf54Q6UWD8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms