Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASC4Q6P4E1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASC4Q6P4E1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASC4Q6P4E1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CASC4Q6P4E1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASC4Q6P4E1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASC4Q6P4E1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASC4Q6P4E1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASC4Q6P4E1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASC4Q6P4E1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASC4Q6P4E1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASC4Q6P4E1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASC4Q6P4E1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASC4Q6P4E1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASC4Q6P4E1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms