Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1N0

CC2D1A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1AQ6P1N0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CC2D1AQ6P1N0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CC2D1AQ6P1N0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms