Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFCAB12Q6NXP0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EFCAB12Q6NXP0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EFCAB12Q6NXP0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms