Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GDF6Q6KF10 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GDF6Q6KF10 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms