Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFMBT2Q5VUG0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SFMBT2Q5VUG0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SFMBT2Q5VUG0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms