Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC183Q5T5S1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC183Q5T5S1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms