Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SLC9B1Q4ZJI4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC9B1Q4ZJI4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms