Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP13A4Q4VNC1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP13A4Q4VNC1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms