Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SP6Q3SY56 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SP6Q3SY56 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms