Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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VAMP3Q15836 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP3Q15836 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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VAMP3Q15836 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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VAMP3Q15836 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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VAMP3Q15836 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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VAMP3Q15836 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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VAMP3Q15836 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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VAMP3Q15836 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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VAMP3Q15836 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VAMP3Q15836 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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