Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA6Q15825 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRNA6Q15825 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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