Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SKIV2LQ15477 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms