Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PUM3Q15397 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PUM3Q15397 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
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