Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 OTUB1-201ENST00000301453 2493 ntTSL 216.52■□□□□ 0.232e-10■■■■□ 25.6
PCBP1Q15365 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.764e-9■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 NSMF-207ENST00000371482 2888 ntTSL 1 (best)16.29■□□□□ 0.21e-7■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.022e-6■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.992e-17■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.552e-17■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.452e-17■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.31e-11■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.761e-11■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.61e-11■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 HES6-207ENST00000417803 474 ntTSL 324.99■■□□□ 1.591e-11■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.564e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.564e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.471e-11■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.154e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.084e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 FUT1-203ENST00000599826 681 ntTSL 1 (best)21.61■■□□□ 1.054e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 FUT1-204ENST00000601931 847 ntTSL 1 (best)21.61■■□□□ 1.054e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.054e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.034e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TCF3-219ENST00000610756 1343 ntTSL 1 (best)21.47■■□□□ 1.038e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 FUT1-205ENST00000601988 815 ntTSL 1 (best)21.35■■□□□ 1.014e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 SMIM29-210ENST00000637920 1093 ntTSL 220.68■□□□□ 0.94e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 SYNGAP1-227ENST00000638142 2499 ntTSL 520.47■□□□□ 0.874e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.864e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 GPAA1-218ENST00000534072 1090 ntTSL 220.43■□□□□ 0.864e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 SMIM29-204ENST00000463083 1487 ntTSL 219.78■□□□□ 0.764e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.764e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 GPAA1-212ENST00000529638 1570 ntTSL 519.59■□□□□ 0.734e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 SMIM29-203ENST00000413013 806 ntTSL 219.55■□□□□ 0.724e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.74e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.621e-9■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 BCL3-207ENST00000474300 819 ntTSL 218.44■□□□□ 0.544e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 ACAT2-202ENST00000467951 856 ntTSL 318.06■□□□□ 0.484e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.325e-6■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.291e-9■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.264e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TAF6-203ENST00000421980 2685 ntTSL 516.45■□□□□ 0.221e-9■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 FUT1-202ENST00000597220 649 ntTSL 1 (best)15.86■□□□□ 0.134e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.071e-9■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.021e-6■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.024e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.074e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.111e-9■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 ZC3H18-204ENST00000564161 4654 ntTSL 214.21□□□□□ -0.134e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.2□□□□□ -0.144e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.174e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.184e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.194e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 GPAA1-215ENST00000530796 936 ntTSL 313.81□□□□□ -0.24e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 ERAL1-203ENST00000461894 1628 ntTSL 1 (best)13.7□□□□□ -0.224e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.245e-6■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.334e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.374e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 ERAL1-208ENST00000583487 695 ntTSL 312.69□□□□□ -0.384e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.534e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TXNRD1-215ENST00000526950 1847 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.554e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TXNRD1-206ENST00000524698 1933 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.574e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TAF6-213ENST00000472509 2551 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.571e-9■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TXNRD1-207ENST00000525265 572 ntTSL 211.03□□□□□ -0.644e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TXNRD1-217ENST00000527688 3858 ntTSL 210.59□□□□□ -0.714e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 ERAL1-204ENST00000471992 1508 ntTSL 59.72□□□□□ -0.854e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TXNRD1-204ENST00000429002 3855 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.854e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.934e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TXNRD1-219ENST00000529546 2018 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.094e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 BCL3-206ENST00000473473 445 ntTSL 28□□□□□ -1.134e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 CTDNEP1-204ENST00000570484 393 ntTSL 27.22□□□□□ -1.254e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.274e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.324e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.364e-8■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.323e-6■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.253e-6■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 CISH-203ENST00000491847 5042 ntTSL 1 (best)13.08□□□□□ -0.323e-6■■■■□ 25.5
PCBP1Q15365 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.254e-7■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.784e-7■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 C6orf136-206ENST00000463794 445 ntTSL 318.29■□□□□ 0.524e-7■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 C6orf136-210ENST00000484551 613 ntTSL 318.24■□□□□ 0.514e-7■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 C6orf136-213ENST00000493705 715 ntTSL 517.71■□□□□ 0.434e-7■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 C6orf136-212ENST00000488383 1337 ntTSL 517.71■□□□□ 0.424e-7■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.124e-7■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 SREBF1-204ENST00000395756 3026 ntTSL 218.57■□□□□ 0.562e-9■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 01e-7■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.261e-7■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.291e-7■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.311e-7■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.321e-7■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.969e-11■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 COMMD7-204ENST00000610160 1987 ntTSL 224.49■■□□□ 1.519e-11■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.089e-11■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.091e-7■■■■□ 25.4
PCBP1Q15365 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.292e-7■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 RNASE1-204ENST00000412779 896 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.592e-7■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 RNASE1-201ENST00000340900 878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.752e-7■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 RNASE1-205ENST00000555698 655 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.772e-7■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 RNASE1-203ENST00000397970 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.852e-7■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 FADS2-204ENST00000517312 588 ntTSL 515.81■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 FADS2-206ENST00000518606 510 ntTSL 47.94□□□□□ -1.142e-6■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.233e-56■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.063e-56■■■■□ 25.3
PCBP1Q15365 UCP2-208ENST00000544615 1004 ntTSL 211.12□□□□□ -0.633e-56■■■■□ 25.3
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