Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HERC3Q15034 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERC3Q15034 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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