Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ODF1Q14990 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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