Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMCO1Q147U7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMCO1Q147U7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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