Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNX2Q13950 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX2Q13950 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms