Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB3Q13509 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB3Q13509 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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