Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FMODQ06828 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FMODQ06828 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FMODQ06828 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FMODQ06828 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FMODQ06828 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FMODQ06828 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FMODQ06828 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FMODQ06828 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FMODQ06828 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FMODQ06828 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FMODQ06828 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FMODQ06828 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FMODQ06828 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FMODQ06828 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FMODQ06828 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FMODQ06828 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FMODQ06828 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FMODQ06828 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FMODQ06828 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FMODQ06828 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FMODQ06828 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FMODQ06828 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FMODQ06828 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
FMODQ06828 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FMODQ06828 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FMODQ06828 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FMODQ06828 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FMODQ06828 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FMODQ06828 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FMODQ06828 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FMODQ06828 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FMODQ06828 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FMODQ06828 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FMODQ06828 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FMODQ06828 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FMODQ06828 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FMODQ06828 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FMODQ06828 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FMODQ06828 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FMODQ06828 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FMODQ06828 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FMODQ06828 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FMODQ06828 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FMODQ06828 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FMODQ06828 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FMODQ06828 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FMODQ06828 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FMODQ06828 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FMODQ06828 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FMODQ06828 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FMODQ06828 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FMODQ06828 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FMODQ06828 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FMODQ06828 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FMODQ06828 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FMODQ06828 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FMODQ06828 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FMODQ06828 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms