Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NHLH2Q02577 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NHLH2Q02577 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms