Protein–RNA interactions for Protein: Q01113

IL9R, Interleukin-9 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL9RQ01113 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL9RQ01113 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL9RQ01113 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL9RQ01113 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL9RQ01113 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL9RQ01113 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL9RQ01113 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL9RQ01113 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL9RQ01113 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL9RQ01113 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL9RQ01113 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL9RQ01113 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL9RQ01113 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms