Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEX3Q00994 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BEX3Q00994 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BEX3Q00994 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms