Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
FAM3AP98173 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3AP98173 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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