Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCNA1P78396 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNA1P78396 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms