Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBB4BP68371 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBB4BP68371 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms